Ostatní diskuse týkající se projektu

Fórum o projektu
Zpráva
Autor
Uživatelský avatar
vkliber
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 10306
Registrován: čtv 29 bře, 2007 10:41
ID CNT statistics: 1
Bydliště: Brušperk, 48 let
Kontaktovat uživatele:

Ostatní diskuse týkající se projektu

#1 Příspěvek od vkliber »

Zatím jsem projel pár jednotek aplikace molecular docking application, aplikace se zdá stabilní (na Intel(R) Core(TM)2 Quad CPU Q9400 @ 2.66GHz, WinXP), v paměti si vezme asi 60MB, jednotky trvají asi 150sec. a je za ně 0.8 kreditu (takže normálka).
Statistiky CNT | Projekty CNT | Distribuované výpočty CNT | SETI CNT | Einstein CNT
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙

Uživatelský avatar
vkliber
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 10306
Registrován: čtv 29 bře, 2007 10:41
ID CNT statistics: 1
Bydliště: Brušperk, 48 let
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#2 Příspěvek od vkliber »

Jednotky jsou rezesílány na 3 PC (minimum quorum = 3, initial replication = 3), a všichni 3 dostanou kredit jako ten co to spočítal za prostřední čas.
Statistiky CNT | Projekty CNT | Distribuované výpočty CNT | SETI CNT | Einstein CNT
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙

rendo
26.3157894737 %
26.3157894737 %
Příspěvky: 245
Registrován: ned 09 pro, 2007 14:25
ID CNT statistics: 3742
Bydliště: Pardubický kraj, Svitavy

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#3 Příspěvek od rendo »

Jakpak se dá sehnat ten pozvánkový kód? Nějak se mi to tam na foru nepodařilo zjistit.

Uživatelský avatar
vkliber
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 10306
Registrován: čtv 29 bře, 2007 10:41
ID CNT statistics: 1
Bydliště: Brušperk, 48 let
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#4 Příspěvek od vkliber »

rendo píše:Jakpak se dá sehnat ten pozvánkový kód? Nějak se mi to tam na foru nepodařilo zjistit.
Pozvánkový kód se většinou získává tak, že napíšeš adminovi projektu, povíš mu že by jsi rád počítal, testoval ... většinou jsou na pozvánkový kód projekty, kde se vyžaduje, aby počtář byl aktivně zapojen do procesu ... sledoval jednokty, reportoval bugy, atd. Je vhodné se i zmínit že počítáš i ostatní (testovací) projekty. No a většinou ti admin pošle pozvánkový kód, nebo ti přímo založí účet a pošle ti heslo.

Jelikož jsem nemohl najít email na admina projektu a neměl jsem zrovna času nazbyt, tak jsem z recese zkusil pozvánkový kód tipnout ... a uhodl jsem hned na poprvé ... jednoduchá (nečekaná ;-) ) logika.
Nezlob se, Pozvánkové kódy by se ve fóru objevovat neměly, ale jsem přesvědčen, že ti bude stačit taky jeden pokus. A kdyby jsi se trápil, tak na fóru ruského týmu ho mezi řádky najdeš :lol: :lol: :lol: .
Statistiky CNT | Projekty CNT | Distribuované výpočty CNT | SETI CNT | Einstein CNT
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙

rendo
26.3157894737 %
26.3157894737 %
Příspěvky: 245
Registrován: ned 09 pro, 2007 14:25
ID CNT statistics: 3742
Bydliště: Pardubický kraj, Svitavy

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#5 Příspěvek od rendo »

Díky za info, opravdu bych na něco tak jednoduchého nepřišel 33aaa . Zatím jsem se nepřipojil, protože odjíždím pryč a nevím jak to bude s připojením na net, ale snad časem pomůžu :smt023.

Uživatelský avatar
Klouda
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 164
Registrován: ned 04 lis, 2007 10:23
ID CNT statistics: 6523
Bydliště: Duchcov

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#6 Příspěvek od Klouda »

Jelikož jsem nemohl najít email na admina projektu a neměl jsem zrovna času nazbyt, tak jsem z recese zkusil pozvánkový kód tipnout ... a uhodl jsem hned na poprvé ... jednoduchá (nečekaná ;-) ) logika.
Díky za nápovědu.
IQE Obrázek ObrázekObrázek     

     

nenym
78.9473684211 %
78.9473684211 %
Příspěvky: 7610
Registrován: úte 13 led, 2009 15:33
rok narození: 0- 0-1956
ID CNT statistics: 10124

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#7 Příspěvek od nenym »

Připadám si jako méněcenný tvor s IQ tyqe. U mě byl úspěšný až šestý pokus.
Blíží se konsolidační balíček pětikolky; šetřím trojbojem - piji staré víno, jím plesnivé sýry a jezdím v autě bez střechy.
UotD 767x Obrázek
1xObrázek 3xObrázek 9xObrázek 12xObrázek Obrázek
Obrázek

Uživatelský avatar
Drago
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 156
Registrován: ned 06 led, 2008 20:42
rok narození: 18 črc 1983
Bydliště: Trebon, Tyn n. Vltavou
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#8 Příspěvek od Drago »

nenym píše:Připadám si jako méněcenný tvor s IQ tyqe. U mě byl úspěšný až šestý pokus.
U me druhy :idea: 45hh
Obrázek Obrázek R.I.P. IQE
Muž tvoří a vychovává svět. Muže však vychovává žena.
-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-MIGUEL DE CERVANTES y SAAVEDRA

Intel i7 920 @3,2GHz * 6GB DDR3 @1600MHz * Gigabyte EX58-UD5 * NVidia GTX 285OC2 1024MB @691/2592/1566MHz * RAID0 4.2TB * Seasonic M12-700 700W * Win 7 x64 Build 7600 RTM
(-: ɐqɯɐɹɐʞ ɾɐ

Uživatelský avatar
Drago
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 156
Registrován: ned 06 led, 2008 20:42
rok narození: 18 črc 1983
Bydliště: Trebon, Tyn n. Vltavou
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#9 Příspěvek od Drago »

Bohuzel u me vsechny jednotky konci stejnou chybou...

Kód: Vybrat vše

<core_client_version>6.4.5</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
 - exit code 195 (0xc3)
</message>
<stderr_txt>
wrapper: starting
wrapper: running ../../projects/boinc.drugdiscoveryathome.com/unzip_1.000_windows_intelx86.exe (-qq -o "./MGLTools*.zip" -d ".")
[./MGLToolsPckgs.zip]
  End-of-central-directory signature not found.  Either this file is not
  a zipfile, or it constitutes one disk of a multi-part archive.  In the
  latter case the central directory and zipfile comment will be found on
  the last disk(s) of this archive.

1 file had no zipfile directory.
No zipfiles found.
app exit status: 0x9
called boinc_finish

</stderr_txt>
]]>
tusite z toho nekdo jestli je chyba u me nebo je to ciste porodni bolest projektu? thx
Obrázek Obrázek R.I.P. IQE
Muž tvoří a vychovává svět. Muže však vychovává žena.
-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-MIGUEL DE CERVANTES y SAAVEDRA

Intel i7 920 @3,2GHz * 6GB DDR3 @1600MHz * Gigabyte EX58-UD5 * NVidia GTX 285OC2 1024MB @691/2592/1566MHz * RAID0 4.2TB * Seasonic M12-700 700W * Win 7 x64 Build 7600 RTM
(-: ɐqɯɐɹɐʞ ɾɐ

nenym
78.9473684211 %
78.9473684211 %
Příspěvky: 7610
Registrován: úte 13 led, 2009 15:33
rok narození: 0- 0-1956
ID CNT statistics: 10124

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#10 Příspěvek od nenym »

Těžko říct, co se děje, nepochybně jsou to porodní bolesti projektu. Z některých sérií se mi spočítají všechny jednotky, z některých vůbec nic, z většiny část. Naštěstí ty, které se nedopočítají, končí chybou po několika vteřinách.
Blíží se konsolidační balíček pětikolky; šetřím trojbojem - piji staré víno, jím plesnivé sýry a jezdím v autě bez střechy.
UotD 767x Obrázek
1xObrázek 3xObrázek 9xObrázek 12xObrázek Obrázek
Obrázek

Uživatelský avatar
vkliber
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 10306
Registrován: čtv 29 bře, 2007 10:41
ID CNT statistics: 1
Bydliště: Brušperk, 48 let
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#11 Příspěvek od vkliber »

nenym píše:Těžko říct, co se děje, nepochybně jsou to porodní bolesti projektu. Z některých sérií se mi spočítají všechny jednotky, z některých vůbec nic, z většiny část. Naštěstí ty, které se nedopočítají, končí chybou po několika vteřinách.
Přesně tak. Odhaduji že to je vždy chybně vygenerována série jednotek. Dneska jsem měl minimálně 100WUs a celkem za to mám 72 kreditů, takže drtivá většina s chybou. Ale jak píše nenym, naštěstí se chyba projeví okamžitě na začátku výpočtu.
Statistiky CNT | Projekty CNT | Distribuované výpočty CNT | SETI CNT | Einstein CNT
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙

Uživatelský avatar
Drago
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 156
Registrován: ned 06 led, 2008 20:42
rok narození: 18 črc 1983
Bydliště: Trebon, Tyn n. Vltavou
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#12 Příspěvek od Drago »

Tak dnes uz to vypada mnohem lip, z dnesnich cca 30ti WUs jen 4 s chybou a 2 redundantni :smt023
Obrázek Obrázek R.I.P. IQE
Muž tvoří a vychovává svět. Muže však vychovává žena.
-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-MIGUEL DE CERVANTES y SAAVEDRA

Intel i7 920 @3,2GHz * 6GB DDR3 @1600MHz * Gigabyte EX58-UD5 * NVidia GTX 285OC2 1024MB @691/2592/1566MHz * RAID0 4.2TB * Seasonic M12-700 700W * Win 7 x64 Build 7600 RTM
(-: ɐqɯɐɹɐʞ ɾɐ

Uživatelský avatar
vkliber
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 10306
Registrován: čtv 29 bře, 2007 10:41
ID CNT statistics: 1
Bydliště: Brušperk, 48 let
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#13 Příspěvek od vkliber »

Pozastavuji se nad novou várkou WUs vypuštěnou včera : rozesílat jednotky, které trvají 1-3 sec. a z toho času je navíc většina spotřebována spuštěním wrapperu, rozbalením jednotky z archívu a následné zabalení pro odeslání :
<core_client_version>6.4.5</core_client_version>
<![CDATA[
<stderr_txt>
wrapper: starting
wrapper: running ../../projects/boinc.drugdiscoveryathome.com/unzip_1.011_windows_intelx86.exe (-qq -o "./MGLTools*.zip" -d ".")
wrapper: running ../../projects/boinc.drugdiscoveryathome.com/7za_1.023_windows_intelx86.exe (e ligand.mol2.7z)
wrapper: running ./Python25/python.exe (make_sitecustomize.py ".")
wrapper: running ./Python25/python.exe ("./MGLToolsPckgs/Support/sitecustomize.py")
wrapper: running ./Python25/python.exe ("./MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Utilities24/prepare_ligand4.py" -l ligand.mol2 -o ligand.pdbqt)
wrapper: running ../../projects/boinc.drugdiscoveryathome.com/7za_1.023_windows_intelx86.exe (a ligand.pdbqt.7z ligand.pdbqt)
called boinc_finish
</stderr_txt>
]]>

mi připadá jako mrhání časem.

Když si odhadnu čas (výpočetní, síťový i celkový) potřebný na vygenerování jednotek, odeslání na klienty, spočítání, odeslání zpátky na server, přiřazení výsledků, validaci jednotek, přidělení kreditu, vygenerování statistik a já nevím co ještě, tak rychleji by to měli spočítané na jedné mašině mimo boinc 33ooo .
Statistiky CNT | Projekty CNT | Distribuované výpočty CNT | SETI CNT | Einstein CNT
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙

nenym
78.9473684211 %
78.9473684211 %
Příspěvky: 7610
Registrován: úte 13 led, 2009 15:33
rok narození: 0- 0-1956
ID CNT statistics: 10124

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#14 Příspěvek od nenym »

Totéž jsem se pokoušel kritizovat v jejich fóru, umravnil mě moderátor, že to anouncovali. Testovací jednotky dalšího testu. Zkouší jenom tyto obslužné funkce, za 35s práce (elapsed time) kredit 0,01 až 0,02, opravdu královský kreditový výnos. Že to má smysl se záhy ukázalo, i tyto jednotky občas končí chybou. Viz vlákna Autodock 1.23 a Very short Wu´s, very low Credit's.
Blíží se konsolidační balíček pětikolky; šetřím trojbojem - piji staré víno, jím plesnivé sýry a jezdím v autě bez střechy.
UotD 767x Obrázek
1xObrázek 3xObrázek 9xObrázek 12xObrázek Obrázek
Obrázek

Uživatelský avatar
Drago
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 156
Registrován: ned 06 led, 2008 20:42
rok narození: 18 črc 1983
Bydliště: Trebon, Tyn n. Vltavou
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#15 Příspěvek od Drago »

Stahuje se nekomu prace na tomto projektu? Me uz asi 14 dni halsi na vsech PC's nasledujici...

4.7.2009 16:49:45 DrugDiscovery Sending scheduler request: To fetch work.
4.7.2009 16:49:45 DrugDiscovery Requesting new tasks
4.7.2009 16:49:50 DrugDiscovery Scheduler request completed: got 0 new tasks
4.7.2009 16:49:50 DrugDiscovery Message from server: No work sent
4.7.2009 16:49:50 DrugDiscovery Message from server: molecular docking application is not available for your type of computer.


pritom v Server status nejake jednotky k odeslani jsou...
Obrázek Obrázek R.I.P. IQE
Muž tvoří a vychovává svět. Muže však vychovává žena.
-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-MIGUEL DE CERVANTES y SAAVEDRA

Intel i7 920 @3,2GHz * 6GB DDR3 @1600MHz * Gigabyte EX58-UD5 * NVidia GTX 285OC2 1024MB @691/2592/1566MHz * RAID0 4.2TB * Seasonic M12-700 700W * Win 7 x64 Build 7600 RTM
(-: ɐqɯɐɹɐʞ ɾɐ

fake
26.3157894737 %
26.3157894737 %
Příspěvky: 282
Registrován: čtv 07 čer, 2007 08:52
ID CNT statistics: 55

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#16 Příspěvek od fake »

poslete mi prosim nekdo ten pozvankovy kod?:) me se to nepovedlo ani na po 6:)

Uživatelský avatar
Drago
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 156
Registrován: ned 06 led, 2008 20:42
rok narození: 18 črc 1983
Bydliště: Trebon, Tyn n. Vltavou
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#17 Příspěvek od Drago »

fake píše:poslete mi prosim nekdo ten pozvankovy kod?:) me se to nepovedlo ani na po 6:)
Bohuzel puvodni kod uz nefunguje a ten novy netusim... :-(
Obrázek Obrázek R.I.P. IQE
Muž tvoří a vychovává svět. Muže však vychovává žena.
-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-_-MIGUEL DE CERVANTES y SAAVEDRA

Intel i7 920 @3,2GHz * 6GB DDR3 @1600MHz * Gigabyte EX58-UD5 * NVidia GTX 285OC2 1024MB @691/2592/1566MHz * RAID0 4.2TB * Seasonic M12-700 700W * Win 7 x64 Build 7600 RTM
(-: ɐqɯɐɹɐʞ ɾɐ

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 19635
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#18 Příspěvek od forest »

Je to škoda, také nemám účet na tomto projektu. Právě nyní vydali více než 200.000 WU, což je pro tento projekt fakt náklad. Dokonce pracijí i na podpoře CUDA.

Uživatelský avatar
vkliber
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 10306
Registrován: čtv 29 bře, 2007 10:41
ID CNT statistics: 1
Bydliště: Brušperk, 48 let
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#19 Příspěvek od vkliber »

forest píše:...
Právě nyní vydali více než 200.000 WU, což je pro tento projekt fakt náklad.
...
Náklad to je, jednotky jsou ovšem 15-ti minutové, takže očekávám že i přes relativně málo počtářů to bude rychle pryč.
Statistiky CNT | Projekty CNT | Distribuované výpočty CNT | SETI CNT | Einstein CNT
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙

nenym
78.9473684211 %
78.9473684211 %
Příspěvky: 7610
Registrován: úte 13 led, 2009 15:33
rok narození: 0- 0-1956
ID CNT statistics: 10124

Re: Ostatní diskuse týkající se projektu

#20 Příspěvek od nenym »

Mehartsi 22sss , vidím, že na svém stroji ID 1025 úspěšně drtíš 5.11 aplikaci a mně na obou Ubuntu 64bit ani nezačne unzip package. 7za, zip i unzip executables tam jsou, xml vypadá také smysluplně, ldd nic zajímavého neříká kromě toho, že tam není nic dynamicky linknutého.....kde mám dál houbařit?
píše mi to tohle

Kód: Vybrat vše

<core_client_version>6.10.17</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
process exited with code 22 (0x16, -234)
</message>
<stderr_txt>
execv: No such file or directory
</stderr_txt>
]]>
normální průběh začíná

Kód: Vybrat vše

wrapper: starting
16:13:30 (31408): wrapper: running ../../projects/boinc.drugdiscoveryathome.com/unzip_1.103_i686-pc-linux-gnu (-qq -o "./MGLTools*.zip" -d ".")
Hmm.......na 32bit Ubuntu na hračce Atom aplikace 2.15 jede jako utržená z řetězu
Na fóru mi ani zpm neporadil :smt102
Blíží se konsolidační balíček pětikolky; šetřím trojbojem - piji staré víno, jím plesnivé sýry a jezdím v autě bez střechy.
UotD 767x Obrázek
1xObrázek 3xObrázek 9xObrázek 12xObrázek Obrázek
Obrázek

Odpovědět

Zpět na „DrugDiscovery@Home“