Základní informace o projektu

[Zelvuska]

Jedná se o podprojekt mateřského projektu World Community Grid. Pro zapojení do výpočtů, je tedy třeba si jej v nastavení osobního účtu přímo na stránkách projektu povolit: http://www.worldcommunitygrid.org/

Tento projekt se zabývá novým designem léků proti AIDS.
Hlavním cílem projektu je studium "dockingu" inhibitoru HIV-1 proteásy.

[forest]

Stejně jako u RICE, byl i na tomto podprojektu snížen výpočetní čas jednotek na průměrných 6 hodin. Poměrově bylo sníženo i ohodnocení, deadline beze změny.

[krahulik]

Videukazka Autodocku v akci:
http://fightaidsathome.scripps.edu/imag ... /1hvr.mpeg

[krahulik]

Pokud mate odevzdanou WU v pending, tak muzete v nekterych pripadech jeji validaci "popostrcit". Pokud by byl problem na serveru apod. muzete tak manualne zaradit WU k validaci. (Toto neplati pro pripady, pokud je vase WU v pending a je pozadovana druha kontrolni WU!)

Jak na to?
Kliknete na danou jednotku ve vasem prehledu - Results Status/Result Name. Pokud se vam objevi v info o jednotce link - Try Validation, mate tuto moznost otevrenou. Po kliknuti se odesle pozadavek na validaci dane WU.

[petnek]

Super, dobrý postřeh . Až bude příležitost hned to vyzkouším.

[petnek]

Včera byl spuštěn 33. experiment tohoto projektu.

[JardaPichSvetla]

Včera byl spuštěn 33. experiment tohoto projektu.

Včera byl ukončen experiment 31, ale experiment 33 je zatim jenom připravený, běží 32.
Alespoň podle statusu podprojektu.

[petnek]

Ano, podle statusu máš pravdu, ale proto jsem připojil link na forum WCG, kde Uplinger informuje o spuštění 33.

[JardaPichSvetla]

Ano, podle statusu máš pravdu, ale proto jsem připojil link na forum WCG, kde Uplinger informuje o spuštění 33.

Nejsem sice nějak extra dobrej v Angličtině, ale jestli jsem si to správně přeložil, tak na tom foru vidim jen oznámení, že bude brzo spuštěnej a nikoliv, že už je.

We will be starting experiment 33 soon. These batches start with 13985. At the request from the researchers we will be running these before finishing experiment 32. So you will see a jump from batch 12900 to 13984.

[petnek]

Ano, máš pravdu, omlouvám se a skláním se až k zemi . Až teď jsem si v té větě dostatečně uvědomil "will" .

[Raziel-CZ]

Umí tento projekt využít i grafickou kartu? Mám nevyužitou Radeon 5770 a rád bych ji zapojil. V současné době počítače jedou jen na Rosetta@home, což je jeden z mála projektů, které k něčemu skutečně jsou. A grafiku, tedy elektřinu, poskytnu jen opět něčemu, co má smysl. FightAIDS@home jej nejspíš má, procesor tomu ale dávat nebudu, rakovina je důležitější.

[nenym]

V systému Boinc nejde ATI GPU zatím využít na žádný biologický projekt. Připravují se ATI aplikace pro DrugDiscovery, Hydrogen a GPUGRID, zatím s obrovskými potížemi. Blíže ve specializovaných vláknech těchto projektů.
Na biologických projektech mimo Boinc lze ATI použít na Foldingu, ale tam je dosti nevýkonná a bere s sebou jedno jádro CPU, lepší využití tam mají nVidie.

[Raziel-CZ]

Nějaký update v této oblasti? Stále stejný dotaz a to využití grafické karty na biologické projekty. Díky

[nenym]

Odpověď bohužel stále stejná. Podle vývojářů biologických projektů, které jsou algoritmicky nesrovnatelně náročnější než matematické projekty, je implementace OpenCL zejména na ATI tak katastrofální, že je to nepoužitelné. Na nVidii je použitelná alespoň CUDA, ATI stream je prý nepoužitelný. Vše vyčteno z různých fór, sám tomu ani za mák nerozumím.