Základní informace o projektu

Fórum o projektu

Moderátoři: petnek, nenym, Zelvuska

Odpovědět
Zpráva
Autor
Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17733
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Základní informace o projektu

#1 Příspěvek od forest » úte 09 čer, 2009 13:14

Jedná se o podprojekt mateřského projektu World Community Grid. Pro zapojení do výpočtů, je tedy třeba si jej v nastavení osobního účtu přímo na stránkách projektu povolit: http://www.worldcommunitygrid.org/

Ze spolupráce WCG, IBM a výzkumných pracovníků AFM (French Muscular Dystrophy Association), CNRS (French National Center for Scientific Research) a univerzity Pierre et Marie Curie, vzešel výzkum zabývající se vzájemnými interakcemi mezi bílkovinami. Výzkum je zaměřen na více než 2200 bílkovin, o nichž se domnívají, že hrají významnou roli při neuromuskulárních onemocněních. Výzkumem jejich struktůry a vzájemné interakce, vzniká databáze informací, které pomohou vědcům při výběru molekul k potlačení nebo posílení vazby makromolekul v této oblasti. To by mělo pomoci k lepšímu způsobu léčby svalové dystrofie a jiných neuromuskulárních onemocnění.

Co je neuromuskulární onemocnění a svalová dystrofie?
Neuromuskulární onemocnění je obecný pojem pro skupinu více než dvou set poruch, které narušují funkci svalů. Většina z nich jsou vzácné (postihující méně než jednu osobu z 2000) a z 80% mají genetický původ. Projevují se jak v dětském věku, tak i v dospělosti. Tyto chronické onemocnění vedoucí ke snížení svalové síly, způsobují vážné postižení motorických funkcí (pohybu, dýchání atd.) a poruchy vyjadřování.

I přes pokroky v léčebných postupech, v současnosti neexistuje lék pro osoby postižené neuromuskulárním onemocněním.

Uživatelský avatar
krahulik
52.6315789474 %
52.6315789474 %
Příspěvky: 1217
Registrován: úte 09 led, 2007 10:33

Re: Základní informace o projektu

#2 Příspěvek od krahulik » ned 19 črc, 2009 23:22

The second phase of the HCMD project involves 2246 proteins, and 137 652 178 995 positions will be processed. This is 13.24 times the number of positions of phase I.

Project progress page
Stav k 21.9.2009 Zpracovano 5 364 975 jednotek, to predstavuje 38 63 117 055 pozic (2.81%).
Stav k 2.7 2009 Currently we have received results from 324955 workunits.This is 158316420 positions of 137652178995 (0.12%)

Obrazek by mel byt automaticky aktualizovan.
Obrázek
Vice zde.
Naposledy upravil(a) krahulik dne čtv 24 zář, 2009 16:05, celkem upraveno 1 x.
Obrázek
Obrázek

Uživatelský avatar
krahulik
52.6315789474 %
52.6315789474 %
Příspěvky: 1217
Registrován: úte 09 led, 2007 10:33

Re: Základní informace o projektu

#3 Příspěvek od krahulik » čtv 24 zář, 2009 15:56

Kazda jednotka obsahuje tzv. deadman switch mechanismus.

Jestli jsem pochopil spravne, tak pokud nemate za 4 hodiny vypoctu (CPU time) jednotku zpracovanou z vice nez 60 %, tak dojde k jejimu automatickemu zastaveni, resp. k jejimu vynucenemu ukonceni po 8 hodinach (CPU time) vypoctu.
To znamena, ze pokud mate za 4 hod CPU time zpracovano vice nez 60 %, tak se snazi jednotka byt kompletni pred dosazenim 8 hodin. Zadna jednotka by nemela trvat dele nez 8 hodin (CPU time).

:arrow: Vzhledem k nedavne zmene delky vypoctu (zvyseni casu) od varky HCMD2_0050 doslo k posunu techto hranic, tzn. ze pokud mate jednotku zpracovanou z vice nez 60 % za dobu vypoctu 6 hodin (CPU time), kompletni by mela byt pred dosazenim 12 hodin (CPU time). Takze pokud nebude CPU time pres 12 hodin, je to dobre.

Bohuzel se mi nezdarilo vyhledat pripad, kdy dojde k aktivaci "deadman switche" a jak je pote takova jednotka oznacena/ohodnocena.

:idea: Limity jsou nastaveny na CPU time, nikoliv na Wallclock time (nove verze BM by mely mit v preferencich volbu typu zobrazeni casu).
Obrázek
Obrázek

Odpovědět

Zpět na „Help Cure Muscular Dystrophy - World Community Grid“