Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty

Fórum o projektu

Moderátoři: petnek, nenym, Zelvuska

Zpráva
Autor
ondy
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 168
Registrován: pon 27 lis, 2006 09:00

Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty

#1 Příspěvek od ondy » pon 10 zář, 2007 09:12

Zdravim,

chtel jsem se zeptat, jeslti ma cenu prenastavovat standardni delku vypoctu na Rosettinych preferencich. Ted jsou tam 3 hodiny, jde mi o to, jestli by nebylo lepci tam dat 24 hodin z duvodu lepsiho zkoumani proteinu. Moc tomu nerozumim, nejde mi o kredity, ale o to, aby kdyz uz to pocitam, tak to za neco stalo :wink:
Diky mockrat za kazdy nazor!

Uživatelský avatar
Dugi
31.5789473684 %
31.5789473684 %
Příspěvky: 364
Registrován: čtv 05 črc, 2007 14:16
rok narození: 16 bře 1987
ID CNT statistics: 6455
Bydliště: Jihlava
Kontaktovat uživatele:

#2 Příspěvek od Dugi » pon 10 zář, 2007 09:30

Ahoj Ondy, pokud vím tak Rosetta (stejně jako každý jiný projekt) má pevně danou přesnost a rozsáhlost výpočtů s jakou počítá. A ta se nedá změnit. A neboj se, že by tvůj počítač za ty tři hodiny prozkoumal ten protein jen nějak povrchně. Vůbec ne, za ty tři hodiny ho provrtá skrz naskrz. :wink:
Obrázek

Moje malé diskusní fórum o kosmonautice - http://vesmir.thos.cz

Na čem počítám:
Falcon - noteboook Samsung R530 - Pentium Dual Core 2.1 GHz, 3 GB RAM

ondy
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 168
Registrován: pon 27 lis, 2006 09:00

#3 Příspěvek od ondy » pon 10 zář, 2007 10:45

Ahoj Dugi,
me teda zarazi, proc to neni jak treba u Seti - dostanu jednotku a na jeji slozitosti zalezi, jak dlouho ji budu pocitat. Tady mi prijde, ze kdyz jsem kousek od nejakeho vysledku a uplnou 3 hodiny, tak se to zarizne a basta. Me by se vic libilo mit aspon pocit, ze jsem to dopocital, tzn. tak, aby to bylo jak u Seti. A prijde mi divny, aby to tam teda takhle meli nastavovaci.
Fakt tomu moc nerozumim :idea:

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17633
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#4 Příspěvek od forest » pon 10 zář, 2007 11:07

Rosetta je prozatím jedinným projektem kde jde skutečně nastavit délku výpočtu u jednotek a to v rozmezí 1-24h.
Modely Rosetty se zpracovávají následujícím způsobem. Stáhne se ti model, který je pro výpočet v základním tvaru. Poté se hledá takový řetězec (fold), který bude mít nejnižší energii. Výpočet probíhá generováním náhodných tvarů a u každého se vždy zpracovává výpočet jeho energie, přičemž se uchovává v paměti ten nejlepší fold. Každý takový výpočet vygenerovaného tvaru trvá několik minut.

Čím delší je tedy doba výpočtu, tím více kombinací se u daného modelu zpracuje a tím je větší šance na nalezení foldu s co možná nejmenší energií. Tabulka takových foldů je zde na stránkách projektu. Stejný protein se zpracovává na spoustě počítačů, takže nemusíte mít strach že když máte nastavenou třeba jen hodinu výpočtu na model, že tím výpočty odfláknete, ale náročnost výpočtů i kreditové ohodnocení je stejné bez rozdílu nastavení, tak proč nemít nastaveno třeba alespoň 12 hodin že?
Default je nastaveno pro všechny 3hodiny/model.

Jinak článek popisující podrobně průběh výpočtu na Rosettě najdete na našem webu zde.

ondy
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 168
Registrován: pon 27 lis, 2006 09:00

#5 Příspěvek od ondy » pon 10 zář, 2007 11:45

To forest:
Diky mockrat za paradni popis, nastavim si asi tech 12 hodin, tim se taky trochu snizi traffic jak u nas, tak u Rossety.
Jeste jednou dikec!

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17633
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#6 Příspěvek od forest » pon 10 zář, 2007 14:19

Není zač.
S tím trafficem jsi to přesně odhadl, je to zároveň i přínos pro projekt, protože prodloužením výpočtu se sníží množství dat posílaných/přijímaných na obou stranách a hlavně na straně serveru projektu to je pak znát.

ondy
21.0526315789 %
21.0526315789 %
Příspěvky: 168
Registrován: pon 27 lis, 2006 09:00

#7 Příspěvek od ondy » pon 10 zář, 2007 15:28

A nemam tam teda "lupnout" 24hodin?

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17633
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#8 Příspěvek od forest » pon 10 zář, 2007 21:03

Když ti to nevadí, tak je to to nejlepší, ale to je na každém. Někdo chce krátkou dobu výpočtů aby měl průběžně přidělovaný kredit po 3 hodinách a jinému jde o kvalitu a kredit mu stačí po 24h, to je prostě volba každého a je to tak myslím správné.
Osobně kdybych se vrátil aktivně na Rosettu, tak bych jel na maximum, tak jak už se těším na dlouhé jednotky na QMC. Stovky hodinových jednotek v zásobě není moc pro mě.

Uživatelský avatar
Dugi
31.5789473684 %
31.5789473684 %
Příspěvky: 364
Registrován: čtv 05 črc, 2007 14:16
rok narození: 16 bře 1987
ID CNT statistics: 6455
Bydliště: Jihlava
Kontaktovat uživatele:

#9 Příspěvek od Dugi » pon 10 zář, 2007 22:49

Jen bych chtěl doplnit tuto debatu následující otázkou:

Když napříkald nachám Rosettu aby počítala každý projekt na tři hodiny tak dostanu x bodů.
Znamená to tedy, že když nechám jednu jednotku kalkulovat 24 hodin, že dostanu 8x bodů?
Obrázek

Moje malé diskusní fórum o kosmonautice - http://vesmir.thos.cz

Na čem počítám:
Falcon - noteboook Samsung R530 - Pentium Dual Core 2.1 GHz, 3 GB RAM

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17633
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

#10 Příspěvek od forest » úte 11 zář, 2007 07:10

Ano, kredit je přidělován podle počtu zpracovaných tvarů a u nich vypočítané energie. Mělo by to být přímo úměrném +/- délce času výpočtu. On ten čas výpočtu není přesně na hodiny, protože vždy odhaduje než se pustí do dalšího tvaru zda jej stihne v daném čase zpracovat a pokud už ne, tak se ukončí a jede se další model.

Uživatelský avatar
Cyberian
5.26315789474 %
5.26315789474 %
Příspěvky: 17
Registrován: stř 03 říj, 2007 01:57
Kontaktovat uživatele:

nastaveni

#11 Příspěvek od Cyberian » úte 09 říj, 2007 11:48

Brouzdal jsem forem a koukam na Rossetta@home. Ani jsem nemel tuchu, ze jde nastavit delka. Ja davam jednoznacne 24h :wink:

Jirka_k1
Příspěvky: 1
Registrován: ned 04 lis, 2007 16:59

nastavení

#12 Příspěvek od Jirka_k1 » ned 04 lis, 2007 17:33

Čaute, prosím Vás, kde nastavím tu délku? Děkuji za odpověď Jirka.

Uživatelský avatar
vkliber
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 9891
Registrován: čtv 29 bře, 2007 10:41
ID CNT statistics: 1
Bydliště: Brušperk, 48 let
Kontaktovat uživatele:

Re: nastavení

#13 Příspěvek od vkliber » ned 04 lis, 2007 20:10

Jirka_k1 píše:Čaute, prosím Vás, kde nastavím tu délku? Děkuji za odpověď Jirka.
Na stránkách projektu se přihlásíš na svůj účet http://boinc.bakerlab.org/rosetta/home.php a klepneš na Rosetta@home preferences dále na Edit Rosetta@home preferences a pak tam je chlívek Target CPU run time kde si nastavíš požadovanou dobu výpočtu jednotky.
Statistiky CNT | Projekty CNT | Distribuované výpočty CNT | SETI CNT | Einstein CNT
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙

zirkonxx
Příspěvky: 2
Registrován: sob 05 led, 2008 23:37

Re: Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty

#14 Příspěvek od zirkonxx » sob 05 led, 2008 23:55

Muze mi prosim vas nekdo potvrdit zkusenost ze se pri zvyseni doby vypoctu zvysuje i kredit ? (vice bodu nez jen nasobek)
zatim se mi to tak zdalo
Dekuji za odpoved Zbynek

Honza
57.8947368421 %
57.8947368421 %
Příspěvky: 2397
Registrován: pát 03 lis, 2006 10:46

Re: Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty

#15 Příspěvek od Honza » ned 06 led, 2008 13:38

Ano, melo by to tak byt.
Hlavni vyhodu spatruji se snizeni naroku na prenos dat.

Uživatelský avatar
Prazdroj
42.1052631579 %
42.1052631579 %
Příspěvky: 683
Registrován: čtv 17 led, 2008 10:19
Bydliště: Liberec, 32 let

#16 Příspěvek od Prazdroj » pon 28 led, 2008 10:50

A když se nechá defaultní "not selected", budou se stahovat různě dlouhé úkoly dle nálady projektu?

Uživatelský avatar
Zelvuska
Moderátor
Moderátor
Příspěvky: 563
Registrován: ned 25 bře, 2007 21:21

Re:

#17 Příspěvek od Zelvuska » pon 28 led, 2008 11:58

Prazdroj píše:A když se nechá defaultní "not selected", budou se stahovat různě dlouhé úkoly dle nálady projektu?
Defaultni nastaveni jsou tri hodiny... tusim, ze to je napsano nejakym malym pismem pod tim popisem...

Uživatelský avatar
Prazdroj
42.1052631579 %
42.1052631579 %
Příspěvky: 683
Registrován: čtv 17 led, 2008 10:19
Bydliště: Liberec, 32 let

#18 Příspěvek od Prazdroj » čtv 31 led, 2008 15:32

Zelvuska píše:Defaultni nastaveni jsou tri hodiny... tusim, ze to je napsano nejakym malym pismem pod tim popisem...
O těch třech hodinách tu někdo už psal, ale ptal jsem se na to znovu proto, že když jsem to nechal defaultní, časy byly různé od 5 do 40 tisíc vteřin. Ale třeba je to jen starým počítačem, jak moc se s ním v tu dobu pracuje a obtížností jednotlivých úkolů. Po nastavení na 24 hodin to ale už opravdu počítá stanovenou dobu.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 17633
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Re: Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty

#19 Příspěvek od forest » čtv 31 led, 2008 18:56

Ono to chce špíš odevzdat pár výsledků, aby se ten odhad na výpočetní čas srovnal.

Uživatelský avatar
Zelvuska
Moderátor
Moderátor
Příspěvky: 563
Registrován: ned 25 bře, 2007 21:21

Re: Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty

#20 Příspěvek od Zelvuska » čtv 31 led, 2008 19:03

forest píše:Ono to chce špíš odevzdat pár výsledků, aby se ten odhad na výpočetní čas srovnal.
Ja mel takovy pocit, ze si to hlida sama aplikace, ze kdyz uz se blizi finalni dobe, tak si odhadne, jestli se dalsim modelem trefi nebo ne a kdyz ne, tak skonci... Ale nevim to jiste...

Odpovědět

Zpět na „Rosetta@Home“