Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty
Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty
Zdravim,
chtel jsem se zeptat, jeslti ma cenu prenastavovat standardni delku vypoctu na Rosettinych preferencich. Ted jsou tam 3 hodiny, jde mi o to, jestli by nebylo lepci tam dat 24 hodin z duvodu lepsiho zkoumani proteinu. Moc tomu nerozumim, nejde mi o kredity, ale o to, aby kdyz uz to pocitam, tak to za neco stalo
Diky mockrat za kazdy nazor!
chtel jsem se zeptat, jeslti ma cenu prenastavovat standardni delku vypoctu na Rosettinych preferencich. Ted jsou tam 3 hodiny, jde mi o to, jestli by nebylo lepci tam dat 24 hodin z duvodu lepsiho zkoumani proteinu. Moc tomu nerozumim, nejde mi o kredity, ale o to, aby kdyz uz to pocitam, tak to za neco stalo
Diky mockrat za kazdy nazor!
- Dugi
- 31.5789473684 %
- Příspěvky: 364
- Registrován: čtv 05 črc, 2007 14:16
- rok narození: 16 bře 1987
- ID CNT statistics: 6455
- Bydliště: Jihlava
- Kontaktovat uživatele:
Ahoj Ondy, pokud vím tak Rosetta (stejně jako každý jiný projekt) má pevně danou přesnost a rozsáhlost výpočtů s jakou počítá. A ta se nedá změnit. A neboj se, že by tvůj počítač za ty tři hodiny prozkoumal ten protein jen nějak povrchně. Vůbec ne, za ty tři hodiny ho provrtá skrz naskrz.
Moje malé diskusní fórum o kosmonautice - https://vesmir.thos.cz
Na čem počítám:
Falcon - noteboook Samsung R530 - Pentium Dual Core 2.1 GHz, 3 GB RAM
Ahoj Dugi,
me teda zarazi, proc to neni jak treba u Seti - dostanu jednotku a na jeji slozitosti zalezi, jak dlouho ji budu pocitat. Tady mi prijde, ze kdyz jsem kousek od nejakeho vysledku a uplnou 3 hodiny, tak se to zarizne a basta. Me by se vic libilo mit aspon pocit, ze jsem to dopocital, tzn. tak, aby to bylo jak u Seti. A prijde mi divny, aby to tam teda takhle meli nastavovaci.
Fakt tomu moc nerozumim
me teda zarazi, proc to neni jak treba u Seti - dostanu jednotku a na jeji slozitosti zalezi, jak dlouho ji budu pocitat. Tady mi prijde, ze kdyz jsem kousek od nejakeho vysledku a uplnou 3 hodiny, tak se to zarizne a basta. Me by se vic libilo mit aspon pocit, ze jsem to dopocital, tzn. tak, aby to bylo jak u Seti. A prijde mi divny, aby to tam teda takhle meli nastavovaci.
Fakt tomu moc nerozumim
- forest
- Admin webu a fóra CNT
- Příspěvky: 19628
- Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
- rok narození: 03 bře 1977
- ID CNT statistics: 71
- Bydliště: Újezd u Brna
Rosetta je prozatím jedinným projektem kde jde skutečně nastavit délku výpočtu u jednotek a to v rozmezí 1-24h.
Modely Rosetty se zpracovávají následujícím způsobem. Stáhne se ti model, který je pro výpočet v základním tvaru. Poté se hledá takový řetězec (fold), který bude mít nejnižší energii. Výpočet probíhá generováním náhodných tvarů a u každého se vždy zpracovává výpočet jeho energie, přičemž se uchovává v paměti ten nejlepší fold. Každý takový výpočet vygenerovaného tvaru trvá několik minut.
Čím delší je tedy doba výpočtu, tím více kombinací se u daného modelu zpracuje a tím je větší šance na nalezení foldu s co možná nejmenší energií. Tabulka takových foldů je zde na stránkách projektu. Stejný protein se zpracovává na spoustě počítačů, takže nemusíte mít strach že když máte nastavenou třeba jen hodinu výpočtu na model, že tím výpočty odfláknete, ale náročnost výpočtů i kreditové ohodnocení je stejné bez rozdílu nastavení, tak proč nemít nastaveno třeba alespoň 12 hodin že?
Default je nastaveno pro všechny 3hodiny/model.
Jinak článek popisující podrobně průběh výpočtu na Rosettě najdete na našem webu zde.
Modely Rosetty se zpracovávají následujícím způsobem. Stáhne se ti model, který je pro výpočet v základním tvaru. Poté se hledá takový řetězec (fold), který bude mít nejnižší energii. Výpočet probíhá generováním náhodných tvarů a u každého se vždy zpracovává výpočet jeho energie, přičemž se uchovává v paměti ten nejlepší fold. Každý takový výpočet vygenerovaného tvaru trvá několik minut.
Čím delší je tedy doba výpočtu, tím více kombinací se u daného modelu zpracuje a tím je větší šance na nalezení foldu s co možná nejmenší energií. Tabulka takových foldů je zde na stránkách projektu. Stejný protein se zpracovává na spoustě počítačů, takže nemusíte mít strach že když máte nastavenou třeba jen hodinu výpočtu na model, že tím výpočty odfláknete, ale náročnost výpočtů i kreditové ohodnocení je stejné bez rozdílu nastavení, tak proč nemít nastaveno třeba alespoň 12 hodin že?
Default je nastaveno pro všechny 3hodiny/model.
Jinak článek popisující podrobně průběh výpočtu na Rosettě najdete na našem webu zde.
- forest
- Admin webu a fóra CNT
- Příspěvky: 19628
- Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
- rok narození: 03 bře 1977
- ID CNT statistics: 71
- Bydliště: Újezd u Brna
Když ti to nevadí, tak je to to nejlepší, ale to je na každém. Někdo chce krátkou dobu výpočtů aby měl průběžně přidělovaný kredit po 3 hodinách a jinému jde o kvalitu a kredit mu stačí po 24h, to je prostě volba každého a je to tak myslím správné.
Osobně kdybych se vrátil aktivně na Rosettu, tak bych jel na maximum, tak jak už se těším na dlouhé jednotky na QMC. Stovky hodinových jednotek v zásobě není moc pro mě.
Osobně kdybych se vrátil aktivně na Rosettu, tak bych jel na maximum, tak jak už se těším na dlouhé jednotky na QMC. Stovky hodinových jednotek v zásobě není moc pro mě.
- Dugi
- 31.5789473684 %
- Příspěvky: 364
- Registrován: čtv 05 črc, 2007 14:16
- rok narození: 16 bře 1987
- ID CNT statistics: 6455
- Bydliště: Jihlava
- Kontaktovat uživatele:
Jen bych chtěl doplnit tuto debatu následující otázkou:
Když napříkald nachám Rosettu aby počítala každý projekt na tři hodiny tak dostanu x bodů.
Znamená to tedy, že když nechám jednu jednotku kalkulovat 24 hodin, že dostanu 8x bodů?
Když napříkald nachám Rosettu aby počítala každý projekt na tři hodiny tak dostanu x bodů.
Znamená to tedy, že když nechám jednu jednotku kalkulovat 24 hodin, že dostanu 8x bodů?
Moje malé diskusní fórum o kosmonautice - https://vesmir.thos.cz
Na čem počítám:
Falcon - noteboook Samsung R530 - Pentium Dual Core 2.1 GHz, 3 GB RAM
- forest
- Admin webu a fóra CNT
- Příspěvky: 19628
- Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
- rok narození: 03 bře 1977
- ID CNT statistics: 71
- Bydliště: Újezd u Brna
Ano, kredit je přidělován podle počtu zpracovaných tvarů a u nich vypočítané energie. Mělo by to být přímo úměrném +/- délce času výpočtu. On ten čas výpočtu není přesně na hodiny, protože vždy odhaduje než se pustí do dalšího tvaru zda jej stihne v daném čase zpracovat a pokud už ne, tak se ukončí a jede se další model.
nastaveni
Brouzdal jsem forem a koukam na Rossetta@home. Ani jsem nemel tuchu, ze jde nastavit delka. Ja davam jednoznacne 24h
- vkliber
- Admin webu a fóra CNT
- Příspěvky: 10306
- Registrován: čtv 29 bře, 2007 10:41
- ID CNT statistics: 1
- Bydliště: Brušperk, 48 let
- Kontaktovat uživatele:
Re: nastavení
Na stránkách projektu se přihlásíš na svůj účet http://boinc.bakerlab.org/rosetta/home.php a klepneš na Rosetta@home preferences dále na Edit Rosetta@home preferences a pak tam je chlívek Target CPU run time kde si nastavíš požadovanou dobu výpočtu jednotky.Jirka_k1 píše:Čaute, prosím Vás, kde nastavím tu délku? Děkuji za odpověď Jirka.
Statistiky CNT | Projekty CNT | Distribuované výpočty CNT | SETI CNT | Einstein CNT
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙
Re: Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty
Muze mi prosim vas nekdo potvrdit zkusenost ze se pri zvyseni doby vypoctu zvysuje i kredit ? (vice bodu nez jen nasobek)
zatim se mi to tak zdalo
Dekuji za odpoved Zbynek
zatim se mi to tak zdalo
Dekuji za odpoved Zbynek
Re: Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty
Ano, melo by to tak byt.
Hlavni vyhodu spatruji se snizeni naroku na prenos dat.
Hlavni vyhodu spatruji se snizeni naroku na prenos dat.
Re:
Defaultni nastaveni jsou tri hodiny... tusim, ze to je napsano nejakym malym pismem pod tim popisem...Prazdroj píše:A když se nechá defaultní "not selected", budou se stahovat různě dlouhé úkoly dle nálady projektu?
- Prazdroj
- 42.1052631579 %
- Příspěvky: 683
- Registrován: čtv 17 led, 2008 10:19
- Bydliště: Liberec, 32 let
O těch třech hodinách tu někdo už psal, ale ptal jsem se na to znovu proto, že když jsem to nechal defaultní, časy byly různé od 5 do 40 tisíc vteřin. Ale třeba je to jen starým počítačem, jak moc se s ním v tu dobu pracuje a obtížností jednotlivých úkolů. Po nastavení na 24 hodin to ale už opravdu počítá stanovenou dobu.Zelvuska píše:Defaultni nastaveni jsou tri hodiny... tusim, ze to je napsano nejakym malym pismem pod tim popisem...
- forest
- Admin webu a fóra CNT
- Příspěvky: 19628
- Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
- rok narození: 03 bře 1977
- ID CNT statistics: 71
- Bydliště: Újezd u Brna
Re: Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty
Ono to chce špíš odevzdat pár výsledků, aby se ten odhad na výpočetní čas srovnal.
Re: Nastaveni delky vypoctu v preferencich Rosetty
Ja mel takovy pocit, ze si to hlida sama aplikace, ze kdyz uz se blizi finalni dobe, tak si odhadne, jestli se dalsim modelem trefi nebo ne a kdyz ne, tak skonci... Ale nevim to jiste...forest píše:Ono to chce špíš odevzdat pár výsledků, aby se ten odhad na výpočetní čas srovnal.