Stránka 1 z 1

Základní informace o projektu

Napsal: úte 30 led, 2007 20:58
od forest
Trocha info o tomto projektu:

Další z projektů který je zaměřený podobně jako Predictor a QMC, na předpovídání struktury proteinů.

Konkrétně využívá Tanpaku tzv. Brownovu dynamiku, která je založena na simulaci pohybu atomů v proteinu pomocí tzv. Brownova pohybu. Brownův pohyb je obyčejný náhodný pohyb molekul v prostředí, způsobený tím, že prostředí má danou teplotu. Jelikož příroda upřednostňuje stavy s nejmenší energií (proto má např. kapka vody či Zeměkoule tvar koule), principem je najít stav proteinu s nejmenší energií. Pomocí Brownové dynamice se tento stav najde řešením rovnice popisující pohyb atomů v molekule, ve které vystupují např. viskozita prostředí, tření mezi atomy a také nahodilý faktor určující např. směr pohybu atomů. Tato metoda umožňuje značně spolehlivě počítat strukturu i velkých systémů.

Jen pro zajímavost Tanpaku je v japonštině protein.

Projekt by měl dávat přesnější výsledky než Predictor, ovšem né tak kvalitní jako QMC.

Nemusím asi připomínat že stejně jako Predictor a QMC, výsledky i tohoto projektu mají pomoci při výzkumu a vývoji léků na mnohé zákeřné choroby.