WCG - OpenPandemics - COVID-19

[forest]

Sepsal jsem na web krátké info o tomto novém podprojektu WCG:
https://www.czechnationalteam.cz/conten ... s-covid-19

Do novinek přidám novinku až zítra.

[Abby]

Super

[Dzordzik]

Velmi dobrá zpráva:
World Community Grid: September Update: OpenPandemics - COVID-19
The researchers and the World Community Grid tech team are continuing their work to get the project working on GPU.

Určitě to nebude tak hned, ale už to že na tom dělají je pozitivní. Otázka je pak efektivita zpracování na GPU. uvidíme, řekl slepej.

PS: dávám sem, protože ve fóru jsem nenašel téma k tomuto podprojektu, ke kterému bych to mělo smysl přidat.

[Abby]

...

[Boby_cze]

Myslim, ze se uz neco spocitat muselo jinak by se netestovali vakciny a to nejen na zviratech (v USA dochazi opice), ale take na lidech, cemuz predchazi hodne modelovani a vyrazovani nevhodnych slozek vakciny. O tom je ten vypocetni vykon. Vzhledem k rychlosti s jskou ty testy prisly, tak vypoctu muselo byt opravdu pozehnane.

[Abby]

...

[petnek]

V to samé doufám i já..
Ti co teď ale testují vakcíny už mají něco, co testují. "Naše výpočty" podle mě pořád hledají nejvhodnější látku/sloučeninu proti tomu prevítovi.

[® Plšák Ráďa ®]

Stáhlo mi to tři jednotky beta GPU aplikace.
Tož pokusím se zazásobovat na 10+10 dní

[forest]

Dej prosím vědět výsledky. Tedy délku výpočtu a výši kreditu.

[® Plšák Ráďa ®]

RTX2070S, power limit mám nastaven na 58% (podvoltovaná GK, tj. nejede na plný výkon-šetřím energii, zvyšuji účinnost WATT/kredit ).
Zatím kredit žádný, jsou dva na validaci, oba dva čekáme na kredit 0,4, čas výpočtu extrémně krátký viz. tabulka.

[nenym]

Zatím jsou všechny GPU bety v pendingu - u mě 195 tasků.

[nenym]

Projekt vypustil GPU Beta COVID tasky pro nV a ATI a konečně jsou s kreditem (předchozí batche byly za nulu, ani jsem je neavizoval). Kredit se pohybuje okolo 1 000 plusminus 100, tasky trvají od 2,5 minuty (GTX 2070 SUPER) do 15 minut (GTX 750 Ti).
POZOR kdo ždíme stroj na doraz, tak mu GPU task nepojede, protože si nealokuje celé CPU core, ale k počítání ho potřebuje, bez podpory celého CPU prostě nejede. Pro pamětníky nic nového, poslední WCG GPU aplikace se chovala stejně.

[Leto]

Tak už je to tady! Můžeme počítat OPN na GPU: OpenPandemics - COVID-19 Now Running on Machines with Graphics Processing Units. Task mi na AMD 5500 XT trvá cca 12-14 minut (mám nastaveno 75 % využití CPU, tj. 6 jader/9 vláken). Kredit z 1 tasku 850,9 (u ostatních čekám na validaci), claimed creditem se nedá řídit. GPU tasky začínají na OPNG, zatímco klasické CPU tasky mají na začátku OPN1. Deadline je stejný jako u CPU tasků, tj. týden.
Jsem zvědav, co to udělá se statistikami. To bude masivní boost. Škoda jen, že odznáčky jsou na WCG za čas. Ten GPU tasky moc nepřidají.

[nenym]

Skutečná potřeba CPU pro podporu GPU tasků (WCG kecá):
nVidia: 1 core (může být HT) na 1 úlohu
ATI: podle výkonu karty 0,3 až 0,6, ale musí být jedno jádro volné, GPU task nedokáže přebít plně vytížený stroj CPU tasky
intel_GPU: nicotné, nevyžaduje volné jádro, dokáže si sebrat výkon z CPU tasků (platí pro vykopávku HD 4600, jak jsou na tom novější nevím)

[Leto]

Tak zatím 43 jednotek, průměrná doba 7m 40s a průměrný kredit cca 700. Jednotky jsou poměrně variabilní, co se týče doby (4,8-13,8 minuty) a kreditu (466,7-983,9 kreditu). Jsem zvědavý, jak to bude dál. O GPU jednotky je velký zájem a jejich denní zásoba (dle WCG fóra asi 81 600 GPU tasků denně) není moc velká.

[Boby_cze]

COVG.jpg (31.17 KiB) Zobrazeno 4125 x

GTX1050Ti

COVG.jpg (31.17 KiB) Zobrazeno 4125 x

GTX1650Super

[petnek]

Na jednotkách pro grafiku se udála nějaká změna. Udávaná odhadovaná doba výpočtu u jednotky se nezměnila a je stále 31 450 GFLOPs. Ale čas výpočtu se změnil.
Na Ryzen 5 2600 s GTX 2060 SUPER čas výpočtu vzrostl z cca 2,25 minuty na 5,5-7 minut a kreditové ohodnocení vzrostlo z nějakých 500-700 na +/- 1620.
Taky jsem si všiml, že jednotka se nyní zhruba po 3 minutách výpočtu nyní vrátí na 0% a počítá se znovu. U WU v Pending validation je k dispozici Result Log a tam je vidět, že první část počítá CPU "AutoGrid" a pak nastupuje GPU na "AutoDock".
Dalším poznatkem pro mě je, že pokud jsou vytížena všechna vlákna CPU až na jedno pro GPU WCG, čas výpočtu je u mě o 40% horší, s ubývajícím počtem zatížených vláken se situace zlepšuje až na uvedených 5,5-7 minut při jen jednom běžícím výpočtu WCG GPU.
Podle mých výpočtů tedy dostanu z WCG 235 000 kreditů za den při plném vytížení CPU, kdežto při počítání jen OPNG 374 000.