Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

Fórum o projektu
Odpovědět
Zpráva
Autor
v.svantner
42.1052631579 %
42.1052631579 %
Příspěvky: 697
Registrován: sob 11 pro, 2010 16:51

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#461 Příspěvek od v.svantner »

Toni is back and work keeps coming!!!!

Pro všechny, co počítají GG, dny půstu jsou pryč.

Od nové várky mám zatím spočítáno 1536 úloh bez chyby a server valí další práci (https://www.gpugrid.net/server_status.php)

Abby

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#462 Příspěvek od Abby »

Já jich dala 23 a všechny jsou validní a to dokonce i s přetaktovanou grafikou. Ale teď už jsem to vypnula a zapnu to zase až 1. března.

Filip Falta
5.26315789474 %
5.26315789474 %
Příspěvky: 7
Registrován: sob 23 bře, 2019 23:39
ID CNT statistics: 12349

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#463 Příspěvek od Filip Falta »

Momentálně je v zásobě cca 217k pracovních jednotek k odeslání a toto množství se pořád zvyšuje. Každá z jednotek po dokončení vygeneruje novou, a to přibližně 10x.

Očekávat tak můžeme celkově minimálně 2 mil pracovních jednotek. Taková zásoba práce by už měla nějakou dobu vydržet 45cc

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 19635
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#464 Příspěvek od forest »

To je skvělá zpráva pro všechny příznivce biologie !!!
Dříve byl GPUGRID jistotou v pomoci tomuto oboru prostřednictvím grafických karet. Věřím, že tomu tak opět bude.

Uživatelský avatar
Axeli
5.26315789474 %
5.26315789474 %
Příspěvky: 17
Registrován: úte 16 srp, 2016 15:58
ID CNT statistics: 1132

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#465 Příspěvek od Axeli »

Tomu říkám pořádný nárůst aktivních hostů. Po ukončení SETI@home jsem se taktéž vrátil. GPU Users Group se do toho pořádně obul..

btw náš profil už je nějakou dobu v rozkladu, je nějaká šance na opravu? :) http://www.gpugrid.net/team_display.php?teamid=34

v.svantner
42.1052631579 %
42.1052631579 %
Příspěvky: 697
Registrován: sob 11 pro, 2010 16:51

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#466 Příspěvek od v.svantner »

Zdravím.

Pokud GUG zůstanou na GG delší dobu, tak to jistě posila bude, protože jejich HW možnosti jsou bez komentáře.

Odkaz na CNT projde aktualizací, už jsem psal Dušanovi SZ.

Uživatelský avatar
Axeli
5.26315789474 %
5.26315789474 %
Příspěvky: 17
Registrován: úte 16 srp, 2016 15:58
ID CNT statistics: 1132

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#467 Příspěvek od Axeli »

Ahoj, díky za info.

Uživatelský avatar
vkliber
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 10306
Registrován: čtv 29 bře, 2007 10:41
ID CNT statistics: 1
Bydliště: Brušperk, 48 let
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#468 Příspěvek od vkliber »

Axeli píše: stř 15 dub, 2020 15:52 ...
btw náš profil už je nějakou dobu v rozkladu, je nějaká šance na opravu? :) http://www.gpugrid.net/team_display.php?teamid=34
Šance byla využita. Díky za upozornění.
Statistiky CNT | Projekty CNT | Distribuované výpočty CNT | SETI CNT | Einstein CNT
.....::::: Proč se mít nejlépe, když se můžu mít čím dál tím stejně :::::.....
Moje skromná statistika tady , tady , tady nebo grafy.
˙ıɔıqɐɹʞ ʌ ǝןɐ 'ıןʇʎd ʌ ǝɔıɾɐz ǝʇɾndnʞǝu ʎpʞıu ˙˙˙

v.svantner
42.1052631579 %
42.1052631579 %
Příspěvky: 697
Registrován: sob 11 pro, 2010 16:51

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#469 Příspěvek od v.svantner »

Díky moc, Vítku!!

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 19635
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#470 Příspěvek od forest »

Koukám, že Vítek byl rychlejší 33iii
Jen ten popis na všech projektech budeme muset opravit. Většina těch odkazů je po rekonstukci webu a migraci hostingu nefunkční a do popisu bych také trochu sáhnul. Zkusím připravit návrh.

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 19635
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#471 Příspěvek od forest »

Nevím, jak je to možné, ale i když je profil týmu upraven a bez internetových odkazů (tak jak to upravil Vítek), tak se zobrazuje na profilu týmu stále ten původní s chybami. Uvidíme, zda se něco změní k lepšímu. Dám tomu pár dní.

v.svantner
42.1052631579 %
42.1052631579 %
Příspěvky: 697
Registrován: sob 11 pro, 2010 16:51

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#472 Příspěvek od v.svantner »

UPOZORNĚNÍ:

nutné přejít na nové stránky projektu v BM:

https://www.gpugrid.net/

Pouze se ujistěte, zda jde upload. Pokud ano, o nic se nestarejte.

Pokud se jednotky budou načítat dlouho, resp. to bude stát, je nutné vymazat jednotky, zrušit projekt a nově ho natáhnout v BM.

Abby

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#473 Příspěvek od Abby »

Jjj, přešli na https z původního http.

Uživatelský avatar
petnek
Moderátor
Moderátor
Příspěvky: 3669
Registrován: pon 28 led, 2008 12:44
rok narození: 16 kvě 1987
ID CNT statistics: 10883
Bydliště: Tábor
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#474 Příspěvek od petnek »

Abby píše: sob 30 kvě, 2020 18:43 ...u GPUGRID ani vlastně nevím co se tam počítá. Dosáhla jsem tam 10M kreditů a tím končím, v klientovi si nechávám jen Rosettu a WCG a budu opět po měsíci střídat tyhle dva projekty na snížené nastavení...
Co se počítá mě taky zajímá. 5 minut hledání stačilo k tomuto:
  • V sekci webu Science jsou k proklikání 4 témata. Pod těmi jsou zpětně publikovány výsledky i se způsobem identifikace jednotky pro danou věc a žebříček toho, kdo jak přispěl svým výkonem.
  • Tady je stručný popis toho, co se zrovna počítá (nebo mám aspoň teď na grafice já). Jednotky "...MDAD..."
Obrázek

v.svantner
42.1052631579 %
42.1052631579 %
Příspěvky: 697
Registrován: sob 11 pro, 2010 16:51

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#475 Příspěvek od v.svantner »

V současné době se na GG počítá toto (pro ty, co neumí anglicky, zkuste googla):

The purpose of the work is (broadly speaking) methods development, i.e. build a dataset to improve the foundation of future MD-based research.

MDAD workunits are an ambitious effort to map the protein conformational space. Although the scope of the work is general, we expect that virion proteins will be among the very first test cases.

The simulations that we are currently running in GPUGRID are going to be used to help protein folding, including proteins coming from the virus giving COVID19. As you know this effort started before the outbreak and would last for several more months.

As soon as we are able to apply the current GPUGRID database simulations to perform studies related to COVID19 we will let you know the outcome.

In summary, if you are running GPUGRID now, you are contributing to a longer term project that has implications for COVID19 but it is not just specific to it.


V obecné rovině se přínos dobrovolníků zjistí až zpětně po zveřejnění vědecké práce. Za to jsou ty frčky v podobě různě barevného "matese" (pro mladší počtáře - Malé televizní sázení (krátce Mates) byla česká loterie, která fungovala v letech 1967–1994.)

nenym
78.9473684211 %
78.9473684211 %
Příspěvky: 7610
Registrován: úte 13 led, 2009 15:33
rok narození: 0- 0-1956
ID CNT statistics: 10124

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#476 Příspěvek od nenym »

Počítá tedy v principu totéž, co WCG, rosetta a ibercivis, ale výsledky mají mnohem větší vypovídací hodnotu, protože sledují o dva řády delší časový úsek interakce látek, než CPU úlohy. Klasický základní výzkum, o kterém se netuší, který z výsledků a jak bude použit v laboratořích pro aplikovaný, t.j. cílený výzkum. Že si některý projekt do názvu dá covid a derivace toho jména je v prvé řadě marketing, ve fázi výpočetního sievingu nikdo netuší, interakce kterých látek mají nechat počítat. S GPUGRIDEm se dá porovnat pouze non-Boinc Folding, který jej na druhé straně svým výpočetním výkonem o mnoho řádů překonává.
Pokud si někdo myslí, že počítáním projektů s názvem covid atd. přímo přispívá s vývoji vakcíny či dokonce léku, tak je úplně mimo. Je to ryzí prosévání nevhodných kombinací látek, poté následuje základní pořád ještě málo specifický výzkum v laboratoři, až pak cílený a pekelně drahý vývoj léku či vakcíny.
Blíží se konsolidační balíček pětikolky; šetřím trojbojem - piji staré víno, jím plesnivé sýry a jezdím v autě bez střechy.
UotD 767x Obrázek
1xObrázek 3xObrázek 9xObrázek 12xObrázek Obrázek
Obrázek

Uživatelský avatar
RoKro
52.6315789474 %
52.6315789474 %
Příspěvky: 1438
Registrován: pon 31 srp, 2009 08:57
rok narození: 29 črc 1970
ID CNT statistics: 10234
Bydliště: Beroun
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#477 Příspěvek od RoKro »

Teď jsi tady několika lidem zkazil večer :-) A stejně ti nebudou věřit, protože kovid je krátka úplně nejzlejší a kdo proti němu nebojuje, ale obtěžuje slušné lidi nějakou blbou pravdou, ten je fuj :-)
Obrázek

Dzordzik
57.8947368421 %
57.8947368421 %
Příspěvky: 2448
Registrován: ned 12 úno, 2017 00:26
rok narození: 18 zář 1980
ID CNT statistics: 503
Bydliště: Zdounky (u Kroměříže)
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#478 Příspěvek od Dzordzik »

Klasický sieving, který pomáhá nabjít potenciálně zajímavé sloučeniny. Je stejně užitečný jako sieving na PG. Rozdíl je jenom v tom, že tady to směřuje k nalezení vakcíny, kdežto u PG je to čistá matematika. A ta závěrečná myšlenka mi příjde stejně zcestná jako to, že pokud si někdo myslí, že sievingem na PG někdo pomáhá k nalezení např. prvočísla, tak je mimo. je to samozřejmě blbost. Obojí zkracuje čas k nalezení výsledku odstraněním nevhodných kandidátů.
Albert: Dual Xeon E5-2696 V4, Supermicro X10DRG-Q, 64GB DDR4 ECC, 1x GTX 1070, Enermax Platimax 1700W

Uživatelský avatar
RoKro
52.6315789474 %
52.6315789474 %
Příspěvky: 1438
Registrován: pon 31 srp, 2009 08:57
rok narození: 29 črc 1970
ID CNT statistics: 10234
Bydliště: Beroun
Kontaktovat uživatele:

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#479 Příspěvek od RoKro »

Já to pochopil tak, že tenhle sieving vyřazuje kandidáty nevhodné k ničemu. A to, co zbude, se možná bude k něčemu hodit, ale v téhle fázi se rozhodně neví, jestli se to bude hodit na malárii, rakovinu, koronaviry, rotaviry, něco jiného, nebo nakonec vůbec na nic. Takže je to určitě užitečná práce, o tom žádná pochybnost, ale nadšení, že se tím počtář podílí přímo na vývoji léku na COVID, bych mírnil, asi takhle, no.
Obrázek

Uživatelský avatar
forest
Admin webu a fóra CNT
Admin webu a fóra CNT
Příspěvky: 19635
Registrován: pát 27 říj, 2006 10:19
rok narození: 03 bře 1977
ID CNT statistics: 71
Bydliště: Újezd u Brna

Re: Ostatní diskuse k projektu GPUGrid

#480 Příspěvek od forest »

Zde musím souhlasit s Dzordzikem. Eliminace nevhodných kandidátů je klasickým způsobem, jak nerealizovatelný výzku mnoha milionů kombinací v laboratořích pročesat o cca 95% nesmyslných pokusů a zbylé ještě ořezat o málo pravděpodobně úspěšné kombinace látek. Zbylé pokusy ji lze zvládnout jak finančně, tak kapacitně v relativně krátkém čase. Bez toho hrubého výkonu by do toho většina laboratoří vůbec nešla a spousta společností by si vůbec nemohla dovolit takový výzku provozovat.

Odpovědět

Zpět na „GPUGRID“